复杂细胞内表型的流式高通量CRISPR 基因编辑筛选

简介: CRISPR-Cas9 基因组编辑技术的发展催生了新一代创新生命科学应用。在药物发现中,研究人员利用 CRISPR 的精确基因敲除能力,实现了全基因组药物筛选。通过将基因型映射到表型,基于 CRISPR 的表型筛选可以更好地理解药物作用机制(MOA)并发现新的可药靶点。然而,当前的 CRISPR 表型筛选方法高度依赖于对目标表型的显微成像,这一过程限制了通量,并且仅能通过二值荧光信号筛选少量简单表型。为了充分发挥 CRISPR 表型筛选的潜力,本文展示了VisionSort 平台在汇合高通量 CRISPR 筛选方法中的应用,以细胞核转位作为目标表型。作为概念验证,我们展示了一个小规模筛选实验,用于识别调控已知细胞核转位通路的相关基因。 总结: ・传统CRISPR表型筛选方法依赖显微成像与荧光信号,通量有限,仅能分析少量简单表型。 ・VisionSort 平台实现了高通量、无标记的CRISPR表型筛选,本研究以细胞核转位为目标表型,验证了其在识别相关调控基因方面的可行性。